Не совсем. Если железа больше, чем надо, это не страшно. Критично, когда его меньше. Тоесть, магниты можно взять и потоньше.
В аксиальном генераторе толщина магнитов определяется толщиной статора. Дело в том, что магнитное поле стремится замкнуться по кратчайшему пути. И если магнит тонкий, магнитные линии норовят дотянуться от северного полюса до ближайшего южного. Допустим, магнит толщиной 5 мм, а статор+зазоры - 15 мм. Получается, что ближайшим противоположным полюсом оказывается полюс в этом же магните, а не в ответном, расположеном по ту сторону статора. В итоге сквозь катушки пройдет лишь часть магнитного потока. Работать генератор будет, но эффективность получится не ахти. Потому стараются использовать магниты потолще. Но они дорогие.
Я бы так подытожил - толщина магнита должна быть примерно равна половине толщины статора+зазоры. Но это чисто мой вывод, и он может оказаться не совсем верным.
В железных генераторах картина другая. Там распределением поля почти полностью занимается магнитопровод, поскольку воздушный зазор минимальный. И магниты можно использовать более тонкие.